The HMD domain of the PAF complex primes Rad6-Bre1 E3 ligase complexes for H2B ubiquitination
本論文は、AlphaFold モデリングや生化学的再構成を用いて、Paf1 複合体の Prf1 亚基が持つ HMD 領域を介した RING 結合領域（RBR）が、H2B ユビキチン化を担う HULC 複合体の RING 領域を再配置し、触媒的に活性な状態へ誘導する分子機構を解明したことを報告しています。
📄 Category
molecular biology
376 件の論文
23S rRNA modifications stimulate catalytic activity and prevent the formation of alternative structures
本研究は、大腸菌のペプチド結合中心付近にある rRNA 修飾が、リボソームの天然構造を安定化し、非機能的な構造の形成を防ぐことで、触媒効率を向上させていることを示しています。
Linear-time prediction of proteome-scale microbial protein interactions
本研究では、メタゲノム配列から得られる共進化シグナルを活用した対照学習フレームワーク「FlashPPI」を開発し、微生物プロテオーム規模のタンパク質間相互作用を、既存の構造予測モデルと同等の精度を維持しつつ計算コストを大幅に削減して線形時間で予測可能にした。
Spatial organization of myofibroblastic and complement-secreting CAFs in neuroendocrine tumors
本論文は、多臓器にわたる神経内分泌腫瘍の基質微小環境を解析し、細胞外マトリックスのリモデリングを担う筋線維芽細胞と補体分泌能を有する線維芽細胞が、それぞれコラーゲン豊富な領域と腫瘍隣接界面という異なる空間的ニッチに特異的に局在する、保存された基質アーキテクチャを同定した。
Exapted CRISPR-Cas12f homologs drive RNA-guided transcription
この論文は、CRISPR-Cas12f の相同体がシグマ因子と複合体を形成し、ガイド RNA に誘導されてプロモーター配列を必要とせずに RNA ポリメラーゼをリクルートすることで転写を活性化する、新たな RNA 誘導転写メカニズムを解明したことを報告しています。
Herbivorous insects independently evolved salivary effectors to regulate plant immunity by destabilizing the malectin-LRR RLP NtRLP4
本論文は、シロウナギとイナゴがそれぞれ独立して進化させた唾液タンパク質が、植物の免疫受容体 RLP4 を分解することで植物の防御機構を抑制するという、収斂進化の事例を明らかにしたものである。
A full-length single nuclei transcriptomic atlas of human skeletal muscle insulin resistance
この論文は、フルレングス単一核トランスクリプトミクスと安定同位体ラベル化ハイパーインスリン血症性 Euglycemic クランプを統合することで、ヒト骨格筋のインスリン抵抗性を再定義し、MYH7B+ 核の重要性や ZIP14 の役割など、細胞特異的な分子メカニズムと新たな治療標的を明らかにした研究です。
Autophagy induction requires the suppression of potassium influx mediated by phosphatases
本論文は、酵母においてリン酸化酵素 Ppz1 と Ppz2 が主要なカリウム輸送体 Trk1 および Trk2 の活性を抑制して細胞内カリウム濃度を低下させることが、栄養が豊富な条件下でもオートファジーを誘導するために不可欠であることを明らかにしたものである。
The binding of OTULIN restrains LUBAC activity to prevent TNF-driven immunopathology
OTULIN が LUBAC と物理的に結合することで LUBAC の活性を抑制し、TNF 誘発性の過剰な炎症反応と組織損傷を防ぐ重要なブレーキ機構が働いていることが、OTULIN-LUBAC 相互作用を欠損させたマウスモデルを用いた研究から明らかになりました。
Modeling Sex Differences and Neurodegeneration in Repetitive Traumatic Brain Injury Using Drosophila
本研究は、力調整可能な自動化されたショウジョウバエの反復性外傷性脳損傷モデルを開発し、脳損傷後の運動機能や認知機能、タンパク質プロファイル、および神経変性における性差を明らかにすることで、反復性脳外傷の長期的な病態生理と性特異的転帰を理解するための重要なツールを提供した。
Fully Phased Telomere-to-Telomere Assemblies for Thoroughbred Horse and Donkey Haplotypes derived from a Mule Illuminate the Peculiar Evolution of Equid Centromeres
この論文は、ウマとロバの雑種であるラバから得られた完全なテロメア間アセンブリを基に、ウマ科動物のセントロメアの可塑性や衛星配列とセントロメア機能の非連関など、従来解明されていなかったゲノム構造と進化のメカニズムを明らかにしたものです。
Targeted DNA methylation editing in vivo
本研究では、Cre 依存性の CRISPR 技術を用いた 3 種類のマウス系統を開発・特徴づけし、生体内および生体外で特定の遺伝子座への DNA メチル化付着を可能にし、DNA メチル化が遺伝子発現に及ぼす因果関係が遺伝子座に依存することを示しました。
Epigenetic regulation of TERRA transcription, R-loop formation, telomere integrity and metacyclogenesis by base J in Leishmania major.
この論文は、リーシュマニア原虫において塩基 J が TERRA の転写制御、R ループ形成、テロメア完全性、およびメタシクリック段階への分化を調節し、その欠損が転写異常とテロメア損傷を引き起こして寄生虫の生存率を低下させることを示しています。
Synergistic Notch-WNT Activation Underlies Pediatric Dilated Cardiomyopathy
本論文は、小児特発性拡張型心筋症が成人とは異なり、Notch と WNT 信号経路の共活性化が病態の中心にあり、この経路の阻害が心機能を改善することを示し、年齢に特異的な治療戦略の必要性を提唱しています。
Antagonist binding actively disrupts interleukin-1 receptor dynamics to block co-receptor recruitment
本論文は、分子動力学シミュレーションと柔軟性モデリングを組み合わせることで、IL-1 受容体拮抗薬が単なる活性型構造の安定化阻害ではなく、D3 ドメインの柔軟性を能動的に増大させる動的メカニズムを通じて共受容体のリクルートを阻止し、シグナル伝達を遮断することを明らかにしました。
HIF-1α coordinates adrenal steroidogenesis through direct transcriptional control and regulation of miRNA biogenesis
本論文は、低酸素条件下で HIF-1αが副腎ステロイド生成酵素の転写を直接制御するだけでなく、miRNA 生合成関連遺伝子の発現を調節することで転写後制御を統合し、副腎ステロイド生成を調整する新たなメカニズムを解明したものである。
Molecular Diversity and Recombination Patterns of the ORF7 (Nucleocapsid) Gene in Betaarterivirus americense Variants Circulating from Lima, Peru
ペルーのリマ地域で循環する豚繁殖・呼吸器症候群ウイルス 2 型（PRRSV-2）の ORF7 遺伝子を解析したところ、異なる系統の共循環と系統間での組換えイベントが確認され、抗原性に関わる領域に多様な変異が蓄積していることが明らかになった。
Longitudinal in vivo human wound healing model defines key role for smooth muscle cells in ECM remodeling
この論文は、ヒトの創傷治癒における細胞外マトリックスのリモデリングを平滑筋細胞が支配し、その過程で重要な役割を果たす TIMP1 の発現低下が糖尿病性潰瘍などの治癒不全のメカニズムであることを、単一細胞および空間トランスクリプトミクスを用いた縦断的解析により明らかにしたものである。
Unified function of FACT in mammalian chromatin replication and transcription, dissolving and restoring nucleosomes to counteract genome aggregation
FACT は哺乳類の複製と転写においてヒストンを一時的に分解して再構築する役割を果たし、核小体の秩序ある維持を通じてゲノム構造の凝集を防ぎ、染色体の正常な機能と 3 次元構造を担保している。
RNA-DNA triplex-forming miRNAs define an evolutionarily recent chromatin regulatory mechanism
この論文は、miRNA が Argonaute2 と RNA-DNA 三重鎖を介してクロマチンに結合し、転写を制御する新たなメカニズムを同定し、これが霊長類に特有の進化的に最近の調節機構であることを示しています。